EmirdaÄŸ merkez ve çevresi Anadolu’daki bütün tarihi devirleri yaÅŸamıştır. Davulga-Bademli kasabaları arasındaki Harmanören mevkisinde çıkartılan ve Afyon Müzesinde bulunan tarihi malzemeler bu bölgenin arkaik devri yaÅŸadığını gösterir. Bu bölgede Firikya ve Roma devrine ait eserler çoktur. Firikler zamanında baÅŸkent olan Ordione, ruhanı merkez Pessiniüs (Sivrihisar Ä°lçesi Balhisar Köyü) askeri merkez olan Apmia (Dinar Ä°lçesi) arasında kaldığı için çok geliÅŸmiÅŸtir. Bu üç merkez arasındaki yollar Petera (A.Kurudere Köyü), Oristüs (Çifteler Alikan Köyü), Amorium (Hisar Köyü) geliÅŸmesini saÄŸlamıştır. Ä°lk çağın büyük filozofu Ezop, Amorium’ ludur. Bu devirde yapılan adak taÅŸları A.Piribeyli Kasabasında (Pisia) bolca vardır. Roma zamanında yapılan ünlü malius seferi o devirde Gatalya bölgesi denilen buraya yapılmıştır. Amorium M.S. 4.cü asırda Roma Ä°mparatorluÄŸunun ve dünyanın altıncı büyük ÅŸehridir. Etrafı surlarla çevrilidir. Roma devri kayıtlarında ve Bizans kilise listelerinde büyük dini ve idari merkez olduÄŸu yazılıdır. Halen Hamzahacılı köyündeki türbenin kenarında duran büyük kartal kabartması Roma devrindeki hükümet konağının üzerinde bulunuyordu. Hisar Köyü (Amorium) da kazı çalışmaları her yıl yaz aylarında yapılmakta eski döneme ait tarihi kalıntılar çıkarılmaktadır. Bu eserler bu civarın tarihi zenginliÄŸini göstermektedir.

Türkler bu bölgeye on birinci yüzyılda gelmeye başlamışlardır. Harmanörende bulunup Afyonkarahisar müzesinde sergilenen Türkmen mezar taşları bu devrin belgesidir. O mezar taşları üzerinde Türkmen aşiretlerinin haçlılarla mücadelesi anlatılır. Ayrıca aynı mezar taşlarında Türkmenlerin günlük yaşayışları anlatılmıştır.

Bu bölgeye ilk iskan olan Türkmen aÅŸireti, Morcali Türkmenleridir. Ağılcık- Dağılgan - Pörnek(Yenikapı) – Ekizce – Güneysaray – Tez – Adayazı - Elhan - Gömü - Hamzahacılı - Karacalar - Sığracık - SoÄŸukkuyu - Suvermez - Tabaklar - Türkmenakören - Yarımca - Yavuz - Çiftlik- Eskicırgın (Kuruca Köyü) halkı bu aÅŸirettendir. Daha sonra KarabaÄŸ Türkmenleri gelmiÅŸtir. Bademli - Davulga - Yeniköy - Avdan - A.Aliçomak - Daydalı - EÅŸrefli - Gelincik -Ä°ncik - Karakuyu Köy halkları bu Türkmen boyundandır. EmirdaÄŸ merkezi Musahocalı aÅŸiretindendir. Hicrî 1146 (m. 1734) tarihinde Musul vilayetinin Rakka sancağından Anadolu’ya gönderilen bu aÅŸiret Musul’dan geldiÄŸi için, bir kısım aÅŸiret iskan kayıtlarında Muslucalı ismi ile gelmiÅŸtir. Yedi kabile halinde gelen bu Türkmen aÅŸireti büyük Bozulus aÅŸiretine baÄŸlıdır. AÅŸiret kışın EmirdaÄŸ yaylalarında yazın Çankırı’da yaylamak kaydı ile buraya gelmiÅŸtir. 1752 tarihli 701 numaralı aÅŸiret iskan defterinde bu aÅŸiretin konar göçerlikten men edilip, yerleÅŸmesi ferman buyrulmuÅŸtur. Bunun üzerine Kaçarlı, Ä°ncili, Çilli, Eskicırgın adı verilen ÅŸimdiki yerine iskan olmuÅŸtur. Hicri 1260 (m. 1844) tarihli Afyonkarahisar ÅŸerhi mahkeme kaydında Cırgın Kariyesi (köyü), Ä°ncili Mahallesi ismi geçer. AÅŸiretin diÄŸer kabilelerinde tamburacı cemaati, Suvermez Köyüne, OÅŸili Cemaati, Türkmenakören ve Yarımca Köyüne, Hacıfakılı Cemaati Hamzahacılı Köyüne, Caferli Cematide muhtelif köylere yerleÅŸmiÅŸtir.

Daha sonra Boynuyonlu (Türkmen) aşireti gelerek Alibeyce, Beyköy, Gökçeyaka, Kılıçlı Kavlaklı, Burunarkaç, Gözeli, Kırkpınar, Bağlıca, Köylerine iskan olmuşlardır.
Bunun yanı sıra Emirdağ ve civarında Karakeçili, Karatekeli, Horzumlu Yörükleride Balcam, Başkonak, Çatallı, Dereköy, Emirin, Soğukkuyu, Tez, Demircili, Türkmen, Çaykışla, Güveçci Köylerinde iskan olmuştur. Ayrıca 1877-1950 yılları arasında Rumeliden gelen muhtelif göçmenlerde Hisar, Salihler, Toklucak, Yarıkkaya, Umraniye, Ablak, Aydınyaka, Beyören. Camili, Eskiakören, Kılıçlar, Karayatak, Yusufağa, Topdere, Köylerine yerleşmişlerdir.

EmirdaÄŸ ve köyleri 1850′ye kadar kısmen Barçınlı (Bayat Ä°lçesi) kısmen de vahid-i Barçınlı’ ya (Bolvadin Kemerkaya Kasabası’na) baÄŸlanmış, 1850′den sonra musluca nahiyesi kurulmuÅŸtur. 1870 yılında Aziziye ismiyle ilçe merkezi olmuÅŸtur. Barçınlı (Bayat Ä°lçesi) han-ı barçın (EskiÅŸehir Han Ä°lçesi) nahiyeleri, 130 adet köy Aziziye’ ye baÄŸlanmıştır. 1937 yılında Aziziye adı kaldırılarak güneyinde bulunan EmirdaÄŸlarına izafeten EmirdaÄŸ ismini almıştır. 1918′de baÅŸlayan 1922′de biten KurtuluÅŸ Savaşında EmirdaÄŸ stratejik olarak önemli bir yer iÅŸgal etmiÅŸtir.
Bölge, Yunanlılar tarafından 16 AÄŸustos 1921′de iÅŸgal edilmiÅŸ ve 22 Eylül 1921′de iÅŸgalden kurtulmuÅŸtur.

İşgalde Yunanlılar Emirdağ, Haymana, Mihalıççık ve bölgesinde 66 köyün tamamını ve 57 köyün bir bölümünü yakıp yıkmışlardır.

09 Aralık 1921′de Atatürk ve erkan-ı harp miralayı Arif Bey EmirdaÄŸ’ a gelmiÅŸtir. Atatürk 25 Mart 1922′de EmirdaÄŸ’a gelerek savaşın gidiÅŸatını yönetmiÅŸ ve üç gün burada kalmıştır. Ä°stiklal Savaşında düşmanın hava akınları ile ÅŸehit düşen iki MehmetçiÄŸin aziz hatıralarına hürmeten 1963 yılında ilçe turizm ve kalkındırma derneÄŸi tarafından Suvermez Köyünde ve yol kenarında bir ÅŸehitler abidesi yaptırılmış olup daha sonra ÅŸehitlik milli savunma bakanlığı adına tahsis edildiÄŸinden abide restore edilmiÅŸtir. Her yıl 15 Mayıs’ta anma töreni bu ÅŸehitlikte yapılmaktadır. Ayrıca Tez Köyünde de beÅŸ Ä°stiklal Savaşı ÅŸehidinin mezarı bulunmaktadır.