KaynaÅŸlı’nın tarihi M.S. 395 yıllarına kadar uzanır. Roma’nın ikiye ayrılması ile Düzce ve Bolu havalesi DoÄŸu Bizanslıların hakimiyeti altında kalmış,dolayısıyla KaynaÅŸlı’da bu iki ilin arasında DoÄŸu Bizanslıların himayesine girmiÅŸtir. Ä°pek Yolu üzerinde konaklama kervensaray yeri olmuÅŸtur.O dönemlere ait han yeri kalıntılar ve Sarıçökek Köyü civarında kilise harabeleri bulunmaktadır.
Daha sonraları 1071 Malazgirt Meydan Muharebesinden itibaren ,Selçuklu hakimiyetine girmiş ve Osmanlı İmparatorluğu topraklarına katılmıştır. Hanyeri Camii bu devirlerin izlerini halen korumaktadır.
Osmanlı devri sırasında mevcudiyetini koruyan Çele Köyü,Sarıçökek Köyü,Eskiköy,Darıyeri,Sazköy,Tavakkasbey köyleri bu dönemden kalma halen yerleÅŸim yerleridir.1877-1878 Osmanlı Rus SavÅŸları sırasında ise DoÄŸu Karadeniz yörelerinden,Kafkasya Bölgesinden ve Anadolu’nun bazı kesimlerinden gelen Türklerin bölgeye yerleÅŸmesi ile kaynamak anlamına gelen KaynaÅŸlı Köyü oluÅŸmuÅŸtur.
1944 yılında Düzce ilçesine (şimdiki ilimiz) bağlı bucak ve 1968 yılında Belediye teşkilatı kurulmuştur.
Kaynaşlı ilçesi 09/12/1999 tarihinde 23901 sayılı resmi gazetede yayınlanan 584 sayılı Kanun Hükmünde Kararnameye göre Düzce İline bağlı İlçe olmuştur.